MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022784	ACC	2	6	191503	191508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625433
3502	NC_022784	T	6	6	191520	191525	0 %	100 %	0 %	0 %	557625433
3503	NC_022784	TTA	2	6	191570	191575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625433
3504	NC_022784	ATC	2	6	191596	191601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625433
3505	NC_022784	GCG	2	6	191719	191724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625433
3506	NC_022784	GCA	2	6	191780	191785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625433
3507	NC_022784	GT	3	6	191811	191816	0 %	50 %	50 %	0 %	557625433
3508	NC_022784	CCG	2	6	191842	191847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625433
3509	NC_022784	CCA	2	6	191939	191944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625433
3510	NC_022784	GC	3	6	191955	191960	0 %	0 %	50 %	50 %	557625433
3511	NC_022784	TC	3	6	191969	191974	0 %	50 %	0 %	50 %	557625433
3512	NC_022784	GGC	2	6	191999	192004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625433
3513	NC_022784	CTG	2	6	192016	192021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625433
3514	NC_022784	ATC	2	6	192044	192049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_022784	TGG	2	6	192124	192129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625434
3516	NC_022784	TAT	2	6	192134	192139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625434
3517	NC_022784	CCG	2	6	192171	192176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625434
3518	NC_022784	GTA	2	6	192211	192216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625434
3519	NC_022784	CTT	2	6	192241	192246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625434
3520	NC_022784	GTA	2	6	192293	192298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625434
3521	NC_022784	TAT	2	6	192302	192307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625434
3522	NC_022784	CTC	2	6	192404	192409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625434
3523	NC_022784	GTC	2	6	192470	192475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625434
3524	NC_022784	CAC	2	6	192508	192513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625434
3525	NC_022784	CCA	2	6	192562	192567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625434
3526	NC_022784	GC	3	6	192584	192589	0 %	0 %	50 %	50 %	557625434
3527	NC_022784	GACAC	2	10	192594	192603	40 %	0 %	20 %	40 %	557625434
3528	NC_022784	CTTG	2	8	192610	192617	0 %	50 %	25 %	25 %	557625434
3529	NC_022784	CGG	2	6	192633	192638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625434
3530	NC_022784	GGAA	2	8	192655	192662	50 %	0 %	50 %	0 %	557625434
3531	NC_022784	CAC	2	6	192689	192694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625434
3532	NC_022784	ATA	2	6	192759	192764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625434
3533	NC_022784	CTT	2	6	192829	192834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625434
3534	NC_022784	TTG	2	6	192846	192851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625434
3535	NC_022784	CT	3	6	192853	192858	0 %	50 %	0 %	50 %	557625434
3536	NC_022784	GT	3	6	192878	192883	0 %	50 %	50 %	0 %	557625434
3537	NC_022784	GCA	2	6	192898	192903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625434
3538	NC_022784	ACTTC	2	10	192919	192928	20 %	40 %	0 %	40 %	557625434
3539	NC_022784	CCA	2	6	193000	193005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625434
3540	NC_022784	CCT	2	6	193039	193044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625434
3541	NC_022784	ACT	2	6	193131	193136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625434
3542	NC_022784	CA	3	6	193160	193165	50 %	0 %	0 %	50 %	557625434
3543	NC_022784	AGC	2	6	193177	193182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625434
3544	NC_022784	CAT	2	6	193237	193242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625434
3545	NC_022784	AGA	2	6	193310	193315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_022784	CTT	2	6	193328	193333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625435
3547	NC_022784	TCGC	2	8	193340	193347	0 %	25 %	25 %	50 %	557625435
3548	NC_022784	ATC	2	6	193349	193354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625435
3549	NC_022784	GC	3	6	193365	193370	0 %	0 %	50 %	50 %	557625435
3550	NC_022784	CCCT	2	8	193419	193426	0 %	25 %	0 %	75 %	557625435
3551	NC_022784	CTT	3	9	193433	193441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625435
3552	NC_022784	ACA	2	6	193541	193546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625435
3553	NC_022784	CAC	2	6	193582	193587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625435
3554	NC_022784	CAA	2	6	193595	193600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625435
3555	NC_022784	CCT	2	6	193722	193727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_022784	CTTT	2	8	193767	193774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3557	NC_022784	GGA	2	6	193813	193818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_022784	TTC	2	6	193877	193882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_022784	AAG	2	6	193886	193891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_022784	T	6	6	193922	193927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_022784	TGC	2	6	193992	193997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_022784	TC	3	6	194011	194016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_022784	CGA	2	6	194082	194087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_022784	AATTTC	2	12	194125	194136	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3565	NC_022784	ATGCT	2	10	194171	194180	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3566	NC_022784	TCA	2	6	194204	194209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_022784	N	614	614	194224	194837	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_022784	CTT	2	6	194885	194890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_022784	GCC	2	6	195102	195107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_022784	CGC	2	6	195113	195118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_022784	TTG	2	6	195151	195156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_022784	GCA	2	6	195265	195270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_022784	CAG	2	6	195276	195281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_022784	A	6	6	195460	195465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_022784	CA	3	6	195475	195480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_022784	AAC	2	6	195514	195519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_022784	CAT	2	6	195610	195615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625436
3578	NC_022784	CTC	2	6	195639	195644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625436
3579	NC_022784	TC	3	6	195662	195667	0 %	50 %	0 %	50 %	557625436
3580	NC_022784	CTT	3	9	195682	195690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625436
3581	NC_022784	TA	3	6	195709	195714	50 %	50 %	0 %	0 %	557625436
3582	NC_022784	TAC	2	6	195782	195787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625436
3583	NC_022784	AC	3	6	195887	195892	50 %	0 %	0 %	50 %	557625436
3584	NC_022784	GCT	2	6	195938	195943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625436
3585	NC_022784	GCC	2	6	196067	196072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625436
3586	NC_022784	CCT	2	6	196121	196126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625436
3587	NC_022784	GCAC	2	8	196239	196246	25 %	0 %	25 %	50 %	557625436
3588	NC_022784	GCT	2	6	196318	196323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625436
3589	NC_022784	GCC	2	6	196388	196393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625436
3590	NC_022784	C	6	6	196446	196451	0 %	0 %	0 %	100 %	557625436
3591	NC_022784	ATG	2	6	196452	196457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625436
3592	NC_022784	AAG	2	6	196473	196478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625436
3593	NC_022784	TCC	2	6	196489	196494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625436
3594	NC_022784	GAT	2	6	196516	196521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625436
3595	NC_022784	TCT	2	6	196535	196540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625436
3596	NC_022784	A	6	6	196630	196635	100 %	0 %	0 %	0 %	557625437
3597	NC_022784	GAC	2	6	196712	196717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625437
3598	NC_022784	AGT	2	6	196825	196830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625437
3599	NC_022784	AGA	2	6	196835	196840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625437
3600	NC_022784	CCA	2	6	196875	196880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625437
3601	NC_022784	CTC	2	6	196924	196929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625437
3602	NC_022784	G	6	6	196933	196938	0 %	0 %	100 %	0 %	557625437
3603	NC_022784	GAA	2	6	197001	197006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625437
3604	NC_022784	CGCC	2	8	197031	197038	0 %	0 %	25 %	75 %	557625437
3605	NC_022784	GT	3	6	197073	197078	0 %	50 %	50 %	0 %	557625437
3606	NC_022784	CG	3	6	197093	197098	0 %	0 %	50 %	50 %	557625437
3607	NC_022784	CAA	2	6	197100	197105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625437
3608	NC_022784	ATA	2	6	197149	197154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625437
3609	NC_022784	CAG	2	6	197160	197165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625437
3610	NC_022784	GCA	2	6	197195	197200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625437
3611	NC_022784	TGG	2	6	197254	197259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_022784	GTG	2	6	197304	197309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_022784	GTTG	2	8	197341	197348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_022784	GTT	2	6	197370	197375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_022784	T	6	6	197395	197400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_022784	TCT	2	6	197432	197437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_022784	TGG	2	6	197441	197446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_022784	T	6	6	197452	197457	0 %	100 %	0 %	0 %	557625438
3619	NC_022784	GTG	2	6	197548	197553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625438
3620	NC_022784	TAC	2	6	197590	197595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625438
3621	NC_022784	TA	3	6	197656	197661	50 %	50 %	0 %	0 %	557625438
3622	NC_022784	T	6	6	197725	197730	0 %	100 %	0 %	0 %	557625438
3623	NC_022784	TA	3	6	197819	197824	50 %	50 %	0 %	0 %	557625438
3624	NC_022784	CTA	2	6	197873	197878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625438
3625	NC_022784	TGC	2	6	197884	197889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625438
3626	NC_022784	CGT	2	6	197913	197918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625438
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3750	NC_022784	GCAT	2	8	205803	205810	25 %	25 %	25 %	25 %	557625443
3751	NC_022784	GAGTG	2	10	205816	205825	20 %	20 %	60 %	0 %	557625443
3752	NC_022784	GAAC	2	8	205834	205841	50 %	0 %	25 %	25 %	557625443
3753	NC_022784	TCT	2	6	206056	206061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625443
3754	NC_022784	CAA	2	6	206137	206142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625443
3755	NC_022784	A	9	9	206213	206221	100 %	0 %	0 %	0 %	557625443
3756	NC_022784	ATAG	2	8	206278	206285	50 %	25 %	25 %	0 %	557625443
3757	NC_022784	CA	3	6	206286	206291	50 %	0 %	0 %	50 %	557625443
3758	NC_022784	GGA	2	6	206332	206337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625443
3759	NC_022784	N	650	650	206435	207084	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3760	NC_022784	CTC	2	6	207096	207101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3761	NC_022784	TGC	2	6	207130	207135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3762	NC_022784	GCA	2	6	207205	207210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3763	NC_022784	GT	3	6	207330	207335	0 %	50 %	50 %	0 %	557625444
3764	NC_022784	GCTT	2	8	207340	207347	0 %	50 %	25 %	25 %	557625444
3765	NC_022784	TCC	2	6	207354	207359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625444
3766	NC_022784	CGGC	2	8	207422	207429	0 %	0 %	50 %	50 %	557625444
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3771	NC_022784	AGA	2	6	207665	207670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625444
3772	NC_022784	TGTT	2	8	207715	207722	0 %	75 %	25 %	0 %	557625444
3773	NC_022784	AGC	2	6	207796	207801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625444
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3775	NC_022784	TGA	2	6	207902	207907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625444
3776	NC_022784	T	6	6	207910	207915	0 %	100 %	0 %	0 %	557625444
3777	NC_022784	CTC	2	6	207968	207973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625444
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3781	NC_022784	CGT	2	6	208161	208166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625444
3782	NC_022784	GAG	2	6	208174	208179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625444
3783	NC_022784	GAA	2	6	208290	208295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625444
3784	NC_022784	TGA	2	6	208394	208399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625444
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3790	NC_022784	A	8	8	208651	208658	100 %	0 %	0 %	0 %	557625444
3791	NC_022784	GCT	2	6	208703	208708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3792	NC_022784	AGG	2	6	208798	208803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3793	NC_022784	TG	3	6	208860	208865	0 %	50 %	50 %	0 %	557625445
3794	NC_022784	GTT	2	6	209002	209007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625445
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3810	NC_022784	AT	3	6	209513	209518	50 %	50 %	0 %	0 %	557625446
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3866	NC_022784	GATG	2	8	212044	212051	25 %	25 %	50 %	0 %	557625448
3867	NC_022784	TGG	2	6	212061	212066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625448
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3871	NC_022784	GGA	2	6	212287	212292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625448
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3875	NC_022784	AGT	2	6	212431	212436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625448
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3877	NC_022784	TAC	2	6	212583	212588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625448
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3992	NC_022784	G	6	6	218896	218901	0 %	0 %	100 %	0 %	557625455
3993	NC_022784	GCT	2	6	218921	218926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625455
3994	NC_022784	CGT	2	6	218981	218986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625455
3995	NC_022784	T	7	7	219068	219074	0 %	100 %	0 %	0 %	557625455
3996	NC_022784	GCT	2	6	219129	219134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625455
3997	NC_022784	CT	3	6	219404	219409	0 %	50 %	0 %	50 %	557625455
3998	NC_022784	AAG	2	6	219483	219488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625455
3999	NC_022784	GGGC	2	8	219509	219516	0 %	0 %	75 %	25 %	557625455
4000	NC_022784	GTT	2	6	219695	219700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625455

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